固定ページの編集とFTPについて

お世話になります。

カテゴリ下に固定ページを新規作成し、そのファイル（index.phpや001.phpなど）をFTPでgetして修正を行ってPUTすると、ページに反映はするのですが、再度FTPで更新をした場合に、CMSの管理画面から編集を行おうとすると、最初にputした内容となっています。
FTP更新は反映しないのでしょうか？
この時点でプレビューは1回目のput内容、実際のページは2回目のPUT内容です。

これはページテンプレートと関係がありますか？
ページテンプレートの読み込みはどういう挙動をするのか分からなかったので行っていません。
いまいち固定ページとテンプレートの関係性がわかりません。。。
http://basercms.net/manuals/2/etc/5.html

CMS側で触らなければいいといえばいいのですが、多くのページを移行する段階で気づいたもので。

■ BaserCMSのバージョン：3.0.10
■ レンタルサーバー名：自社
■ スマートURLの利用：　デフォルト
■ 設置フォルダ：　ドキュメントルート
■ 利用しているデータベース：SQLite
■ PHPスキル（自己評価）：　D
■ オーサリングソフトDW