@bon さん こんにちは、自分もWindows環境でBasercmsを使用しています。
（こちらはxamppでcurlとphpのパスを通しており、設定は異なりますが）
そのため、アップデートの際にはインストール時と同様に、下記のファイルをWindows環境用に書き換えています。
vendor/baserproject/baser-core/src/Utility/BcComposer.php
書き換え内容の参考トピック
Windows環境でのアップデートについて
ちなみにBasercmsにログインした状態で、下記のアドレスにアクセスしたら、更新の設定画面が表示されたりしませんでしょうか？
｛basercmsのURL｝/baser/admin/baser-core/plugins/update
